一度关闭的港口包括东京、神户、横滨、清水、那霸、博德和大芬港。以上港口关闭时间由1至3天不等。目前船只已恢复在这些港口挂靠。

　   
　　但位于灾区的仙台港受到很大破坏，目前无法运作。该港地面崩裂、防护堤破损、设备遭严重破坏，货场一片狼藉，损毁严重。毗邻东京的横滨和川崎的港口正常运转，停电令将这两座城市的港口排除在外。横滨港务局发言人通过电话表示，横滨市的主要码头不在市政府的限电计划之中。川崎市港务局的负责人称，川崎市的港口也不在限电令的名单中。据本港船公司负责人说，香港到日本的大部分海运线保持正常。

　　日本在3月11日经历了9级强震以及海啸之后，日本的主要港口受一定程度影响，一度关闭。至3月14日，各港口已经陆续恢复开放。